Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCDC1P59894 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCDC1P59894 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCDC1P59894 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCDC1P59894 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCDC1P59894 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCDC1P59894 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCDC1P59894 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DCDC1P59894 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DCDC1P59894 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCDC1P59894 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCDC1P59894 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DCDC1P59894 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCDC1P59894 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCDC1P59894 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCDC1P59894 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DCDC1P59894 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms