Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTP1P59025 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTP1P59025 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTP1P59025 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTP1P59025 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTP1P59025 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTP1P59025 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTP1P59025 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTP1P59025 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RTP1P59025 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTP1P59025 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTP1P59025 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTP1P59025 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTP1P59025 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTP1P59025 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTP1P59025 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTP1P59025 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTP1P59025 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTP1P59025 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTP1P59025 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RTP1P59025 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTP1P59025 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTP1P59025 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTP1P59025 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTP1P59025 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTP1P59025 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTP1P59025 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTP1P59025 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTP1P59025 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTP1P59025 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTP1P59025 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTP1P59025 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTP1P59025 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTP1P59025 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTP1P59025 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTP1P59025 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTP1P59025 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTP1P59025 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTP1P59025 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTP1P59025 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTP1P59025 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTP1P59025 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RTP1P59025 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RTP1P59025 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTP1P59025 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTP1P59025 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTP1P59025 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTP1P59025 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTP1P59025 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTP1P59025 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTP1P59025 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTP1P59025 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTP1P59025 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RTP1P59025 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RTP1P59025 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RTP1P59025 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTP1P59025 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTP1P59025 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTP1P59025 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTP1P59025 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTP1P59025 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTP1P59025 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTP1P59025 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTP1P59025 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTP1P59025 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTP1P59025 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTP1P59025 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTP1P59025 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTP1P59025 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTP1P59025 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTP1P59025 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTP1P59025 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTP1P59025 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTP1P59025 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTP1P59025 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTP1P59025 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTP1P59025 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTP1P59025 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTP1P59025 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTP1P59025 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTP1P59025 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTP1P59025 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTP1P59025 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTP1P59025 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTP1P59025 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTP1P59025 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTP1P59025 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTP1P59025 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTP1P59025 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTP1P59025 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RTP1P59025 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTP1P59025 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTP1P59025 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTP1P59025 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTP1P59025 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTP1P59025 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTP1P59025 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTP1P59025 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RTP1P59025 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTP1P59025 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms