Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01547P58512 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01547P58512 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01547P58512 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01547P58512 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms