Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP107P57740 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP107P57740 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP107P57740 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP107P57740 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP107P57740 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP107P57740 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP107P57740 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP107P57740 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP107P57740 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP107P57740 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP107P57740 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP107P57740 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP107P57740 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP107P57740 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP107P57740 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUP107P57740 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP107P57740 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP107P57740 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP107P57740 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP107P57740 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP107P57740 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP107P57740 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP107P57740 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP107P57740 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP107P57740 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP107P57740 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP107P57740 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP107P57740 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP107P57740 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP107P57740 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP107P57740 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP107P57740 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP107P57740 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP107P57740 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP107P57740 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP107P57740 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP107P57740 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP107P57740 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP107P57740 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUP107P57740 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP107P57740 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP107P57740 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP107P57740 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP107P57740 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP107P57740 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP107P57740 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP107P57740 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP107P57740 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP107P57740 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP107P57740 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP107P57740 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP107P57740 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP107P57740 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP107P57740 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP107P57740 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP107P57740 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP107P57740 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP107P57740 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP107P57740 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUP107P57740 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP107P57740 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP107P57740 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP107P57740 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP107P57740 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP107P57740 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP107P57740 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP107P57740 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP107P57740 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP107P57740 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP107P57740 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP107P57740 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP107P57740 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP107P57740 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP107P57740 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP107P57740 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP107P57740 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP107P57740 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP107P57740 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP107P57740 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP107P57740 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP107P57740 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP107P57740 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP107P57740 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP107P57740 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP107P57740 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP107P57740 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP107P57740 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP107P57740 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP107P57740 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP107P57740 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP107P57740 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP107P57740 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP107P57740 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP107P57740 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP107P57740 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP107P57740 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP107P57740 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP107P57740 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP107P57740 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms