Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCBP4P57723 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCBP4P57723 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCBP4P57723 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCBP4P57723 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms