Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM33P57088 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM33P57088 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM33P57088 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM33P57088 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM33P57088 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms