Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR1H2P55055 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1H2P55055 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H2P55055 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NR1H2P55055 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H2P55055 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H2P55055 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H2P55055 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H2P55055 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H2P55055 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H2P55055 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H2P55055 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H2P55055 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms