Protein–RNA interactions for Protein: P52757

CHN2, Beta-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN2P52757 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHN2P52757 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHN2P52757 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHN2P52757 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHN2P52757 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHN2P52757 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHN2P52757 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHN2P52757 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHN2P52757 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHN2P52757 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHN2P52757 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHN2P52757 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHN2P52757 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHN2P52757 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHN2P52757 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHN2P52757 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHN2P52757 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHN2P52757 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHN2P52757 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHN2P52757 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHN2P52757 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHN2P52757 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHN2P52757 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHN2P52757 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHN2P52757 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHN2P52757 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHN2P52757 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHN2P52757 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHN2P52757 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHN2P52757 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHN2P52757 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHN2P52757 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHN2P52757 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHN2P52757 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHN2P52757 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHN2P52757 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHN2P52757 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHN2P52757 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHN2P52757 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHN2P52757 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHN2P52757 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHN2P52757 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHN2P52757 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHN2P52757 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHN2P52757 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHN2P52757 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHN2P52757 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHN2P52757 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHN2P52757 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHN2P52757 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHN2P52757 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHN2P52757 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHN2P52757 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHN2P52757 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHN2P52757 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHN2P52757 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHN2P52757 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHN2P52757 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHN2P52757 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHN2P52757 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHN2P52757 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHN2P52757 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHN2P52757 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHN2P52757 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHN2P52757 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHN2P52757 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN2P52757 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN2P52757 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN2P52757 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN2P52757 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN2P52757 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN2P52757 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHN2P52757 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHN2P52757 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHN2P52757 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHN2P52757 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHN2P52757 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHN2P52757 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHN2P52757 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHN2P52757 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHN2P52757 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHN2P52757 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHN2P52757 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHN2P52757 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHN2P52757 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHN2P52757 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHN2P52757 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHN2P52757 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHN2P52757 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHN2P52757 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHN2P52757 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHN2P52757 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHN2P52757 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHN2P52757 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHN2P52757 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHN2P52757 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHN2P52757 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHN2P52757 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHN2P52757 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHN2P52757 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms