Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PRIM1P49642 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRIM1P49642 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRIM1P49642 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRIM1P49642 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
PRIM1P49642 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRIM1P49642 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRIM1P49642 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms