Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTSKP43235 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTSKP43235 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSKP43235 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSKP43235 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSKP43235 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSKP43235 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSKP43235 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSKP43235 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSKP43235 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSKP43235 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSKP43235 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSKP43235 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSKP43235 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSKP43235 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSKP43235 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSKP43235 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSKP43235 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSKP43235 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSKP43235 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSKP43235 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSKP43235 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSKP43235 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSKP43235 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSKP43235 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSKP43235 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSKP43235 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSKP43235 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSKP43235 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSKP43235 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSKP43235 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSKP43235 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSKP43235 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSKP43235 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSKP43235 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSKP43235 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSKP43235 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSKP43235 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSKP43235 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSKP43235 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSKP43235 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSKP43235 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSKP43235 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSKP43235 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSKP43235 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSKP43235 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSKP43235 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSKP43235 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSKP43235 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSKP43235 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSKP43235 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSKP43235 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSKP43235 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSKP43235 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSKP43235 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSKP43235 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSKP43235 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSKP43235 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSKP43235 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSKP43235 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSKP43235 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTSKP43235 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSKP43235 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTSKP43235 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTSKP43235 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSKP43235 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSKP43235 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTSKP43235 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTSKP43235 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTSKP43235 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTSKP43235 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSKP43235 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSKP43235 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSKP43235 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSKP43235 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSKP43235 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSKP43235 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSKP43235 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSKP43235 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSKP43235 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTSKP43235 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSKP43235 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSKP43235 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSKP43235 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTSKP43235 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTSKP43235 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTSKP43235 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CTSKP43235 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTSKP43235 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTSKP43235 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTSKP43235 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTSKP43235 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTSKP43235 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTSKP43235 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTSKP43235 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTSKP43235 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTSKP43235 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTSKP43235 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CTSKP43235 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTSKP43235 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms