Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MTHFRP42898 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTHFRP42898 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTHFRP42898 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTHFRP42898 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTHFRP42898 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTHFRP42898 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTHFRP42898 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTHFRP42898 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTHFRP42898 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTHFRP42898 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTHFRP42898 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTHFRP42898 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MTHFRP42898 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTHFRP42898 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFRP42898 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTHFRP42898 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTHFRP42898 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms