Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PI4KAP42356 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4KAP42356 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PI4KAP42356 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PI4KAP42356 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PI4KAP42356 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms