Protein–RNA interactions for Protein: P40926

MDH2, Malate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH2P40926 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH2P40926 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH2P40926 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDH2P40926 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH2P40926 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH2P40926 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH2P40926 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH2P40926 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDH2P40926 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MDH2P40926 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDH2P40926 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDH2P40926 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MDH2P40926 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDH2P40926 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDH2P40926 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH2P40926 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH2P40926 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDH2P40926 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH2P40926 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH2P40926 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH2P40926 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH2P40926 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDH2P40926 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH2P40926 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDH2P40926 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH2P40926 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH2P40926 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH2P40926 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH2P40926 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH2P40926 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH2P40926 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDH2P40926 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDH2P40926 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDH2P40926 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDH2P40926 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDH2P40926 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDH2P40926 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH2P40926 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH2P40926 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH2P40926 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH2P40926 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH2P40926 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH2P40926 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDH2P40926 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDH2P40926 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MDH2P40926 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH2P40926 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH2P40926 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH2P40926 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH2P40926 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDH2P40926 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDH2P40926 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDH2P40926 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDH2P40926 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH2P40926 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH2P40926 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH2P40926 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH2P40926 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH2P40926 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH2P40926 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH2P40926 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH2P40926 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH2P40926 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH2P40926 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH2P40926 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH2P40926 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH2P40926 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH2P40926 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH2P40926 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH2P40926 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH2P40926 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH2P40926 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH2P40926 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH2P40926 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH2P40926 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH2P40926 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH2P40926 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH2P40926 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH2P40926 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH2P40926 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH2P40926 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH2P40926 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MDH2P40926 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MDH2P40926 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH2P40926 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH2P40926 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH2P40926 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH2P40926 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH2P40926 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH2P40926 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH2P40926 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH2P40926 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH2P40926 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH2P40926 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH2P40926 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH2P40926 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH2P40926 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH2P40926 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH2P40926 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH2P40926 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms