Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HNF1BP35680 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HNF1BP35680 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HNF1BP35680 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HNF1BP35680 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HNF1BP35680 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms