Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXD12P35452 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD12P35452 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD12P35452 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD12P35452 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD12P35452 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD12P35452 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms