Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UQCRC1P31930 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UQCRC1P31930 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UQCRC1P31930 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UQCRC1P31930 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UQCRC1P31930 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UQCRC1P31930 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms