Protein–RNA interactions for Protein: P28799

GRN, Granulins, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRNP28799 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRNP28799 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRNP28799 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRNP28799 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRNP28799 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRNP28799 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRNP28799 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRNP28799 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRNP28799 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRNP28799 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRNP28799 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRNP28799 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRNP28799 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRNP28799 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRNP28799 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRNP28799 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRNP28799 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRNP28799 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRNP28799 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRNP28799 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRNP28799 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRNP28799 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRNP28799 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRNP28799 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRNP28799 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRNP28799 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRNP28799 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRNP28799 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRNP28799 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRNP28799 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRNP28799 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRNP28799 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRNP28799 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRNP28799 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRNP28799 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRNP28799 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRNP28799 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRNP28799 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRNP28799 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRNP28799 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRNP28799 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRNP28799 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRNP28799 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRNP28799 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRNP28799 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRNP28799 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRNP28799 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRNP28799 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRNP28799 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRNP28799 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRNP28799 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRNP28799 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRNP28799 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRNP28799 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRNP28799 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRNP28799 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRNP28799 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRNP28799 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRNP28799 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRNP28799 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRNP28799 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRNP28799 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRNP28799 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRNP28799 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRNP28799 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GRNP28799 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRNP28799 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRNP28799 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRNP28799 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRNP28799 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRNP28799 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRNP28799 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRNP28799 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRNP28799 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRNP28799 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRNP28799 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRNP28799 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRNP28799 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRNP28799 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRNP28799 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRNP28799 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRNP28799 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRNP28799 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRNP28799 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRNP28799 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRNP28799 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRNP28799 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRNP28799 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRNP28799 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRNP28799 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRNP28799 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRNP28799 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRNP28799 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRNP28799 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRNP28799 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRNP28799 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRNP28799 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRNP28799 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRNP28799 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRNP28799 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms