Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
HRCP23327 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
HRCP23327 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
HRCP23327 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
HRCP23327 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
HRCP23327 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
HRCP23327 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
HRCP23327 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
HRCP23327 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
HRCP23327 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
HRCP23327 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
HRCP23327 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
HRCP23327 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
HRCP23327 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
HRCP23327 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
HRCP23327 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
HRCP23327 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
HRCP23327 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
HRCP23327 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
HRCP23327 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
HRCP23327 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
HRCP23327 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
HRCP23327 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
HRCP23327 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
HRCP23327 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
HRCP23327 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
HRCP23327 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
HRCP23327 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
HRCP23327 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
HRCP23327 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
HRCP23327 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
HRCP23327 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
HRCP23327 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
HRCP23327 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.04■■■■■ 4
HRCP23327 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
HRCP23327 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
HRCP23327 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
HRCP23327 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
HRCP23327 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HRCP23327 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HRCP23327 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HRCP23327 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HRCP23327 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HRCP23327 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
HRCP23327 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
HRCP23327 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
HRCP23327 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
HRCP23327 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
HRCP23327 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
HRCP23327 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
HRCP23327 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
HRCP23327 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
HRCP23327 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
HRCP23327 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
HRCP23327 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
HRCP23327 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
HRCP23327 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
HRCP23327 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
HRCP23327 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
HRCP23327 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
HRCP23327 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
HRCP23327 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
HRCP23327 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
HRCP23327 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
HRCP23327 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
HRCP23327 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
HRCP23327 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
HRCP23327 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
HRCP23327 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
HRCP23327 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
HRCP23327 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
HRCP23327 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
HRCP23327 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
HRCP23327 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
HRCP23327 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
HRCP23327 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
HRCP23327 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
HRCP23327 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
HRCP23327 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
HRCP23327 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
HRCP23327 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
HRCP23327 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
HRCP23327 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
HRCP23327 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
HRCP23327 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
HRCP23327 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
HRCP23327 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
HRCP23327 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
HRCP23327 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
HRCP23327 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
HRCP23327 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
HRCP23327 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
HRCP23327 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
HRCP23327 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
HRCP23327 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
HRCP23327 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
HRCP23327 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
HRCP23327 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
HRCP23327 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
HRCP23327 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms