Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6GP18545 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6GP18545 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6GP18545 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms