Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCAP17252 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCAP17252 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCAP17252 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCAP17252 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCAP17252 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCAP17252 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCAP17252 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCAP17252 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCAP17252 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCAP17252 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCAP17252 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCAP17252 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms