Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNT1P13805 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNT1P13805 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNT1P13805 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNT1P13805 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNT1P13805 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNT1P13805 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNT1P13805 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNT1P13805 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNT1P13805 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT1P13805 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT1P13805 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms