Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GNAT1P11488 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GNAT1P11488 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GNAT1P11488 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNAT1P11488 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNAT1P11488 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNAT1P11488 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GNAT1P11488 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GNAT1P11488 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNAT1P11488 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GNAT1P11488 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GNAT1P11488 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GNAT1P11488 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GNAT1P11488 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GNAT1P11488 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GNAT1P11488 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GNAT1P11488 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GNAT1P11488 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GNAT1P11488 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GNAT1P11488 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GNAT1P11488 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GNAT1P11488 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GNAT1P11488 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GNAT1P11488 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GNAT1P11488 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms