Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GLI3P10071 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GLI3P10071 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI3P10071 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI3P10071 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
GLI3P10071 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
GLI3P10071 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GLI3P10071 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
GLI3P10071 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
GLI3P10071 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI3P10071 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
GLI3P10071 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GLI3P10071 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GLI3P10071 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GLI3P10071 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GLI3P10071 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GLI3P10071 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GLI3P10071 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GLI3P10071 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
GLI3P10071 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
GLI3P10071 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GLI3P10071 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GLI3P10071 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GLI3P10071 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GLI3P10071 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GLI3P10071 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
GLI3P10071 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GLI3P10071 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GLI3P10071 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GLI3P10071 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GLI3P10071 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GLI3P10071 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GLI3P10071 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GLI3P10071 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI3P10071 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI3P10071 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI3P10071 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI3P10071 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GLI3P10071 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GLI3P10071 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
GLI3P10071 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GLI3P10071 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GLI3P10071 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GLI3P10071 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
GLI3P10071 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
GLI3P10071 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GLI3P10071 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI3P10071 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GLI3P10071 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GLI3P10071 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI3P10071 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI3P10071 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI3P10071 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI3P10071 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI3P10071 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI3P10071 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GLI3P10071 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GLI3P10071 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GLI3P10071 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GLI3P10071 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
GLI3P10071 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GLI3P10071 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
GLI3P10071 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
GLI3P10071 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
GLI3P10071 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
GLI3P10071 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GLI3P10071 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GLI3P10071 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
GLI3P10071 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
GLI3P10071 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
GLI3P10071 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GLI3P10071 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GLI3P10071 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GLI3P10071 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
GLI3P10071 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GLI3P10071 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
GLI3P10071 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GLI3P10071 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GLI3P10071 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
GLI3P10071 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GLI3P10071 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI3P10071 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI3P10071 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GLI3P10071 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GLI3P10071 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GLI3P10071 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GLI3P10071 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GLI3P10071 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GLI3P10071 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GLI3P10071 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI3P10071 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI3P10071 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI3P10071 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI3P10071 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI3P10071 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GLI3P10071 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
GLI3P10071 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLI3P10071 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLI3P10071 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLI3P10071 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms