Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
U2AF1L5P0DN76 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
U2AF1L5P0DN76 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
U2AF1L5P0DN76 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
U2AF1L5P0DN76 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
U2AF1L5P0DN76 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
U2AF1L5P0DN76 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
U2AF1L5P0DN76 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
U2AF1L5P0DN76 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
U2AF1L5P0DN76 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
U2AF1L5P0DN76 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
U2AF1L5P0DN76 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
U2AF1L5P0DN76 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
U2AF1L5P0DN76 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
U2AF1L5P0DN76 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
U2AF1L5P0DN76 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms