Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN8OSP0DMR3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN8OSP0DMR3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN8OSP0DMR3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN8OSP0DMR3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN8OSP0DMR3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms