Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LYNP07948 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYNP07948 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYNP07948 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYNP07948 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYNP07948 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYNP07948 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYNP07948 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYNP07948 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYNP07948 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYNP07948 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYNP07948 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYNP07948 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LYNP07948 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LYNP07948 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LYNP07948 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LYNP07948 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LYNP07948 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LYNP07948 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LYNP07948 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LYNP07948 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LYNP07948 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LYNP07948 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LYNP07948 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LYNP07948 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LYNP07948 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LYNP07948 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LYNP07948 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LYNP07948 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LYNP07948 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYNP07948 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYNP07948 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYNP07948 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYNP07948 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYNP07948 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYNP07948 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYNP07948 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LYNP07948 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYNP07948 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYNP07948 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYNP07948 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYNP07948 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYNP07948 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYNP07948 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYNP07948 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYNP07948 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYNP07948 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYNP07948 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYNP07948 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYNP07948 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYNP07948 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYNP07948 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYNP07948 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYNP07948 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYNP07948 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYNP07948 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYNP07948 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYNP07948 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYNP07948 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYNP07948 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LYNP07948 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYNP07948 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYNP07948 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYNP07948 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYNP07948 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYNP07948 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYNP07948 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYNP07948 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYNP07948 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYNP07948 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYNP07948 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYNP07948 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYNP07948 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LYNP07948 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LYNP07948 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYNP07948 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYNP07948 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYNP07948 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LYNP07948 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYNP07948 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYNP07948 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYNP07948 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYNP07948 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYNP07948 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYNP07948 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYNP07948 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYNP07948 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYNP07948 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYNP07948 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYNP07948 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYNP07948 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYNP07948 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYNP07948 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYNP07948 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LYNP07948 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYNP07948 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYNP07948 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYNP07948 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYNP07948 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYNP07948 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms