Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAVP06756 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAVP06756 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAVP06756 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGAVP06756 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAVP06756 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms