Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKCGP05129 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCGP05129 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCGP05129 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCGP05129 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCGP05129 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCGP05129 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms