Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DQB1P01920 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DQB1P01920 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DQB1P01920 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DQB1P01920 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DQB1P01920 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DQB1P01920 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DQB1P01920 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQB1P01920 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQB1P01920 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DQB1P01920 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DQB1P01920 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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