Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF6O94906 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF6O94906 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF6O94906 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF6O94906 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF6O94906 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF6O94906 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF6O94906 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF6O94906 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF6O94906 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF6O94906 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF6O94906 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF6O94906 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms