Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF10O60809 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF10O60809 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF10O60809 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF10O60809 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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