Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOBOXO60393 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOBOXO60393 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOBOXO60393 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms