Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LANCL1O43813 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LANCL1O43813 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LANCL1O43813 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LANCL1O43813 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LANCL1O43813 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms