Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FOXO3O43524 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FOXO3O43524 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FOXO3O43524 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FOXO3O43524 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FOXO3O43524 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FOXO3O43524 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FOXO3O43524 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FOXO3O43524 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FOXO3O43524 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FOXO3O43524 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FOXO3O43524 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
FOXO3O43524 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
FOXO3O43524 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
FOXO3O43524 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
FOXO3O43524 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
FOXO3O43524 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FOXO3O43524 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FOXO3O43524 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FOXO3O43524 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FOXO3O43524 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
FOXO3O43524 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
FOXO3O43524 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.95■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FOXO3O43524 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms