Protein–RNA interactions for Protein: O43318

MAP3K7, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K7O43318 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K7O43318 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP3K7O43318 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAP3K7O43318 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAP3K7O43318 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K7O43318 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K7O43318 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K7O43318 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K7O43318 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K7O43318 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K7O43318 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K7O43318 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K7O43318 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms