Protein–RNA interactions for Protein: O15265

ATXN7, Ataxin-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7O15265 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN7O15265 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN7O15265 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN7O15265 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN7O15265 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN7O15265 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATXN7O15265 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN7O15265 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN7O15265 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN7O15265 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN7O15265 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN7O15265 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN7O15265 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN7O15265 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN7O15265 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN7O15265 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN7O15265 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN7O15265 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN7O15265 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN7O15265 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN7O15265 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms