Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
APAF1O14727 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
APAF1O14727 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
APAF1O14727 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
APAF1O14727 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
APAF1O14727 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
APAF1O14727 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
APAF1O14727 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
APAF1O14727 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
APAF1O14727 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
APAF1O14727 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
APAF1O14727 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
APAF1O14727 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
APAF1O14727 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
APAF1O14727 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
APAF1O14727 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
APAF1O14727 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
APAF1O14727 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
APAF1O14727 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
APAF1O14727 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
APAF1O14727 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
APAF1O14727 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
APAF1O14727 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
APAF1O14727 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
APAF1O14727 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
APAF1O14727 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
APAF1O14727 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
APAF1O14727 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
APAF1O14727 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
APAF1O14727 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
APAF1O14727 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
APAF1O14727 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
APAF1O14727 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
APAF1O14727 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
APAF1O14727 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
APAF1O14727 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
APAF1O14727 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
APAF1O14727 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
APAF1O14727 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
APAF1O14727 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
APAF1O14727 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
APAF1O14727 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
APAF1O14727 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
APAF1O14727 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
APAF1O14727 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
APAF1O14727 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
APAF1O14727 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
APAF1O14727 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
APAF1O14727 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
APAF1O14727 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
APAF1O14727 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
APAF1O14727 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
APAF1O14727 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
APAF1O14727 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
APAF1O14727 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
APAF1O14727 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
APAF1O14727 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
APAF1O14727 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
APAF1O14727 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
APAF1O14727 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
APAF1O14727 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
APAF1O14727 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
APAF1O14727 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
APAF1O14727 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
APAF1O14727 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
APAF1O14727 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
APAF1O14727 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
APAF1O14727 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
APAF1O14727 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
APAF1O14727 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
APAF1O14727 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
APAF1O14727 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
APAF1O14727 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
APAF1O14727 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
APAF1O14727 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
APAF1O14727 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
APAF1O14727 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
APAF1O14727 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
APAF1O14727 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
APAF1O14727 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
APAF1O14727 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
APAF1O14727 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
APAF1O14727 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
APAF1O14727 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
APAF1O14727 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
APAF1O14727 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
APAF1O14727 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
APAF1O14727 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
APAF1O14727 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
APAF1O14727 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
APAF1O14727 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
APAF1O14727 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
APAF1O14727 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
APAF1O14727 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
APAF1O14727 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
APAF1O14727 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
APAF1O14727 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
APAF1O14727 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
APAF1O14727 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
APAF1O14727 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms