Protein–RNA interactions for Protein: O00327

ARNTL, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTLO00327 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARNTLO00327 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARNTLO00327 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARNTLO00327 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARNTLO00327 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARNTLO00327 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARNTLO00327 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARNTLO00327 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARNTLO00327 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARNTLO00327 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARNTLO00327 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARNTLO00327 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARNTLO00327 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARNTLO00327 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARNTLO00327 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARNTLO00327 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms