Protein–RNA interactions for Protein: O00322

UPK1A, Uroplakin-1a, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1AO00322 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPK1AO00322 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPK1AO00322 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPK1AO00322 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPK1AO00322 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms