Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR4O00206 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR4O00206 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR4O00206 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR4O00206 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR4O00206 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR4O00206 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR4O00206 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR4O00206 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR4O00206 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TLR4O00206 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TLR4O00206 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TLR4O00206 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TLR4O00206 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TLR4O00206 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR4O00206 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR4O00206 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR4O00206 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR4O00206 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR4O00206 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR4O00206 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR4O00206 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR4O00206 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR4O00206 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR4O00206 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR4O00206 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR4O00206 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR4O00206 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLR4O00206 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLR4O00206 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLR4O00206 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLR4O00206 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLR4O00206 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TLR4O00206 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR4O00206 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR4O00206 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR4O00206 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLR4O00206 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TLR4O00206 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TLR4O00206 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLR4O00206 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLR4O00206 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLR4O00206 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLR4O00206 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLR4O00206 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLR4O00206 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLR4O00206 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLR4O00206 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR4O00206 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR4O00206 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR4O00206 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLR4O00206 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR4O00206 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR4O00206 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLR4O00206 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TLR4O00206 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TLR4O00206 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TLR4O00206 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TLR4O00206 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TLR4O00206 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TLR4O00206 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TLR4O00206 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TLR4O00206 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TLR4O00206 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TLR4O00206 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TLR4O00206 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TLR4O00206 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TLR4O00206 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TLR4O00206 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TLR4O00206 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TLR4O00206 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TLR4O00206 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TLR4O00206 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TLR4O00206 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TLR4O00206 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TLR4O00206 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TLR4O00206 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TLR4O00206 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLR4O00206 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLR4O00206 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLR4O00206 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLR4O00206 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLR4O00206 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLR4O00206 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLR4O00206 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TLR4O00206 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLR4O00206 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLR4O00206 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms