Protein–RNA interactions for Protein: B3GLJ2

PATE3, Prostate and testis expressed protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE3B3GLJ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATE3B3GLJ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATE3B3GLJ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATE3B3GLJ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATE3B3GLJ2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATE3B3GLJ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PATE3B3GLJ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PATE3B3GLJ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATE3B3GLJ2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms