Protein–RNA interactions for Protein: B2RUY7

VWC2L, von Willebrand factor C domain-containing protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2LB2RUY7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWC2LB2RUY7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWC2LB2RUY7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWC2LB2RUY7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VWC2LB2RUY7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VWC2LB2RUY7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms