Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT8L1PA6NM43 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCT8L1PA6NM43 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCT8L1PA6NM43 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCT8L1PA6NM43 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT8L1PA6NM43 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT8L1PA6NM43 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms