Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM200CA6NKL6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM200CA6NKL6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM200CA6NKL6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM200CA6NKL6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM200CA6NKL6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM200CA6NKL6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM200CA6NKL6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM200CA6NKL6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM200CA6NKL6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM200CA6NKL6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM200CA6NKL6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM200CA6NKL6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms