Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP73A6NFT4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP73A6NFT4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP73A6NFT4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP73A6NFT4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP73A6NFT4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP73A6NFT4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms