Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRBA1A5PL33 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRBA1A5PL33 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRBA1A5PL33 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRBA1A5PL33 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KRBA1A5PL33 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRBA1A5PL33 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms