Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM30A4D0T7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM30A4D0T7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM30A4D0T7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM30A4D0T7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms