Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms