Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQ87 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQ87 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQ87 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQ87 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQ87 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQ87 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQ87 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQ87 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQ87 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQ87 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQ87 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQ87 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQ87 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQ87 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQ87 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
U3KQ87 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U3KQ87 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQ87 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQ87 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQ87 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQ87 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQ87 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQ87 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQ87 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQ87 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQ87 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQ87 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQ87 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQ87 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQ87 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQ87 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQ87 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQ87 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQ87 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQ87 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQ87 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQ87 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQ87 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQ87 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQ87 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQ87 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQ87 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQ87 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQ87 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U3KQ87 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U3KQ87 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U3KQ87 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U3KQ87 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQ87 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQ87 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQ87 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQ87 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQ87 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQ87 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQ87 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQ87 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQ87 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQ87 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQ87 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQ87 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQ87 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQ87 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQ87 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQ87 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQ87 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQ87 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQ87 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQ87 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQ87 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQ87 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQ87 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQ87 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQ87 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
U3KQ87 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
U3KQ87 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
U3KQ87 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
U3KQ87 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
U3KQ87 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
U3KQ87 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQ87 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQ87 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQ87 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQ87 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQ87 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQ87 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQ87 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQ87 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQ87 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQ87 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQ87 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQ87 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQ87 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQ87 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQ87 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQ87 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQ87 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQ87 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQ87 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQ87 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms