Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN7Q9Y6W3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN7Q9Y6W3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN7Q9Y6W3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN7Q9Y6W3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN7Q9Y6W3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN7Q9Y6W3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN7Q9Y6W3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN7Q9Y6W3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN7Q9Y6W3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN7Q9Y6W3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN7Q9Y6W3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN7Q9Y6W3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN7Q9Y6W3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAPN7Q9Y6W3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN7Q9Y6W3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN7Q9Y6W3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN7Q9Y6W3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN7Q9Y6W3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN7Q9Y6W3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN7Q9Y6W3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN7Q9Y6W3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN7Q9Y6W3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN7Q9Y6W3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN7Q9Y6W3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN7Q9Y6W3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN7Q9Y6W3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN7Q9Y6W3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms